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西藏地区水痘-带状疱疹病毒临床分离株基因型研究
Research on the genotypes of clinical varicella-zoster virus isolates in Tibet
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]西藏大学医学院基础医学部,拉萨850002 [2]安徽医科大学微生物学教研室
基 金:西藏自治区科技计划项目
年 份:2012
卷 号:32
期 号:11
起止页码:934-938
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的研究西藏地区水痘-带状疱疹病毒临床分离株基因型。方法将临床采集的水痘或带状疱疹患者皮肤水疱液接种至人胚胎成纤维细胞进行病毒分离;对分离得到的病毒运用间接免疫荧光法鉴定,鉴定结果为阳性的病毒继续体外培养以提取其基因组DNA。PCR法扩增并测序水痘.带状疱疹病毒基因组中开放读码框1、21、50、54的部分片段。测序结果与GenBank中水痘一带状疱疹病毒参考株Dumas进行序列比对分析其中单核苷酸多态性,并利用Primer5.0软件进行酶切位点分析,从而确定基因型。结果从临床采集的16份标本中经分离鉴定后得到10株水痘一带状疱疹病毒临床分离株,病毒分离阳性率为62.5%。基因分析结果显示西藏地区10株水痘一带状疱疹病毒临床分离株中基因型Al有3株,基因型A2有4株,基因型J1有3株。结论西藏地区水痘一带状疱疹病毒基因型分布与西藏地区地理位置密切相关。
关 键 词:水痘-带状疱疹病毒 单核苷酸多态性 基因型 西藏地区
分 类 号:R]
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