文献类型：期刊文章

作　　者：李铁柱[1] 杜红岩[2] 刘慧敏[3,4] 乌云塔娜[3,4] 王淋[3,4] 叶生晶[3,4]

机构地区：[1]中南林业科技大学生命科学与技术学院,湖南长沙410004 [2]中国林业科学研究院经济林研究开发中心,河南郑州450003 [3]中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙410004 [4]中南林业科技大学林学院,湖南长沙410004

出　　处：《中南林业科技大学学报》

基　　金：国家林业公益性行业科研专项(201004029);国家十二五科技支撑计划(2012BAD21B0502)

年　　份：2012

卷　　号：32

期　　号：11

起止页码：122-130

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：所构建的杜仲果实和叶片转录组数据库获得了54 471 338条reads数据,包含4 902 420 420nt数据信息,对reads进行拼接,获得了452 421条Contig,总长度为90 705 736 nt;对contig进行拼接后,获得了147 027条Scaffold,总长度为65 877 052 nt;同理,对Scaffold进一步拼接后,获得了49 610条Unigene,总长度为37616 729 nt;Unigene和COG数据库进行比对表明,杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据功能大致可分为25类;杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据GO功能可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类42分支;以KEGG数据库为参考,依据代谢通路可以将转录组中的数据分成125类,包括脂类代谢,DNA剪切,植物激素生物合成,苯丙氨酸生物合成,萜类化合物与类固醇类化合物合成等。

关 键 词：杜仲  果实 叶片 转录组 基因功能

分 类 号：S722.3] Q945[林学类]