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三种分子检测体系的比较及柑橘果园黄龙病监测
Comparative of citrus huanglongbing molecular detection approaches and monitoring of the orchards
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]重庆大学生物工程学院基因工程研究中心,重庆400030
基 金:国家自然科学基金(30971875);国家公益性行业(农业)科研专项(201003067)
年 份:2012
卷 号:39
期 号:6
起止页码:503-507
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:为了评价3种PCR分子检测体系对柑橘黄龙病(citrus huanglongbing,HLB)大田诊断效果,综合比较了常规PCR、巢式PCR和SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR(SG Ⅰ-qPCR)方法对柑橘黄龙病菌检测的灵敏度、特异性和准确度等参数,并用SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR和巢式PCR监测广西柑橘园疑似HLB样品425个,比较了2种检测体系的阳性检出率。基于CQULA04F/CQULA04R引物对的SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR的灵敏度可达10 ag/μL;而巢式PCR灵敏度为100 ag/μL,巢式PCR较常规PCR检测灵敏度高104倍。疑似样品的HLB病原SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR和巢式PCR检出率分别为46.6%、40.0%。各检测体系的灵敏性、特异性、符合度依次为SYBRGreen Ⅰ荧光定量PCR>巢式PCR>常规PCR。研究表明,SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR可作为果园大规模HLB早期诊断和监测的首选,而在缺乏定量检测仪器时,巢式PCR也可用于HLB的检测,但需注意避免空气污染导致的假阳性。
关 键 词:柑橘黄龙病 常规PCR 巢式PCR SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR
分 类 号:S436.66]
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