文献类型：期刊文章

作　　者：郭秀丽[1] 王玉[1] 杨路成[1] 丁兆堂[1]

机构地区：[1]青岛农业大学茶叶研究所,青岛266109

出　　处：《遗传》

基　　金：国家科技支撑计划项目(编号:2011BAD01B01);山东省科技发展计划(编号:2011GNC11010);山东省自然科学基金项目(编号:ZR2010CL021;2009ZRB01654)资助

年　　份：2012

卷　　号：34

期　　号：12

起止页码：1614-1623

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：转录因子CBF(C-repeat-binding factor)广泛存在于各种植物中,是植物抗逆过程中一个重要的调节因子。文章运用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序对茶树(Camellia sinensis)CBF1基因(CsCBF1)序列进行分析,并与茶树基因、模式植物基因组和其他植物CBF基因进行比较,对了解CsCBF1基因密码子使用特性,并为其选择合适的表达系统具有重要意义。结果表明:CsCBF1基因与70个茶树基因对密码子的使用有明显的差异,CsCBF1基因偏好使用以G/C结尾的密码子,而筛选的70个茶树基因偏好使用以A/T结尾的密码子。在密码子使用频率上,CsCBF1基因与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、烟草(Nicotiana tobacum)的差异小于与小麦(Triticum aestivum)、玉米(Zea mays)的差异;因此,拟南芥、烟草更适合作为CsCBF1基因的外源表达宿主。通过分析40种植物CBF基因编码特点可知大部分CBF基因偏好使用以G/C结尾的密码子,这可能与基因的特殊功能有关。

关 键 词：茶树 CBF1基因 密码子偏好性

分 类 号：S571.1]