期刊文章详细信息
利用高密度SNP检测不同猪品种间X染色体选择信号
Detecting selection signatures on X chromosome in pig through high density SNPs
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国农业大学动物科学技术学院,农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室,国家畜禽育种工程实验室,北京100193
基 金:国家自然科学基金项目(编号:30800776);教育部留学回国人员启动基金和北京市科技计划(编号:Z101105000810001)资助
年 份:2012
卷 号:34
期 号:10
起止页码:1251-1260
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:在家猪的培育过程中,许多重要的经济性状受到过高强度的人工选择,高密度SNP标记为通过选择信号检测追踪这些性状经历的选择提供了可能,并能根据选择信号利用生物信息学寻找到与选择相关的基因。X染色体由于其特殊性,在传统的遗传分析中许多针对常染色体的方法往往不适用,需要采取特殊的方法,选择信号检测可以作为一种行之有效的方法对X染色体进行分析。文章利用长白、松辽黑猪和大白3个猪品种,通过品种间选择信号检测方法 XP-EHH,利用高密度SNP标记对X染色体进行选择信号检测,并通过生物信息学分析寻找选择信号区域内重要基因。在长白、松辽黑猪和大白3个品种中分别检测出29、13和15个选择信号区域,每个选择信号区域平均包含3.59、4.92、4.07个SNPs,长白和松辽黑猪、长白和大白有部分重叠选择信号区域,大白和松辽黑猪没有发现重叠选择信号区域。生物信息学分析发现各品种选择信号区域内有与繁殖、免疫等性状相关基因,其中部分在猪中尚未见报道,可作为研究猪相关性状的重要候选基因。
关 键 词:X染色体 选择信号 猪
分 类 号:S828]
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