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期刊文章详细信息

利用高密度SNP检测不同猪品种间X染色体选择信号    

Detecting selection signatures on X chromosome in pig through high density SNPs

  

文献类型:期刊文章

作  者:马云龙[1] 张勤[1] 丁向东[1]

机构地区:[1]中国农业大学动物科学技术学院,农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室,国家畜禽育种工程实验室,北京100193

出  处:《遗传》

基  金:国家自然科学基金项目(编号:30800776);教育部留学回国人员启动基金和北京市科技计划(编号:Z101105000810001)资助

年  份:2012

卷  号:34

期  号:10

起止页码:1251-1260

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:在家猪的培育过程中,许多重要的经济性状受到过高强度的人工选择,高密度SNP标记为通过选择信号检测追踪这些性状经历的选择提供了可能,并能根据选择信号利用生物信息学寻找到与选择相关的基因。X染色体由于其特殊性,在传统的遗传分析中许多针对常染色体的方法往往不适用,需要采取特殊的方法,选择信号检测可以作为一种行之有效的方法对X染色体进行分析。文章利用长白、松辽黑猪和大白3个猪品种,通过品种间选择信号检测方法 XP-EHH,利用高密度SNP标记对X染色体进行选择信号检测,并通过生物信息学分析寻找选择信号区域内重要基因。在长白、松辽黑猪和大白3个品种中分别检测出29、13和15个选择信号区域,每个选择信号区域平均包含3.59、4.92、4.07个SNPs,长白和松辽黑猪、长白和大白有部分重叠选择信号区域,大白和松辽黑猪没有发现重叠选择信号区域。生物信息学分析发现各品种选择信号区域内有与繁殖、免疫等性状相关基因,其中部分在猪中尚未见报道,可作为研究猪相关性状的重要候选基因。

关 键 词:X染色体 选择信号  猪  

分 类 号:S828]

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