文献类型：期刊文章

作　　者：郭莉萍[1,2] 汪雪娇[1] 豆兴茹[1,1] 邱婷[1] 谢洪平[1]

机构地区：[1]苏州大学医学部药学院,江苏苏州215123 [2]重庆科技学院化学化工学院,重庆401331

出　　处：《化学研究与应用》

年　　份：2012

卷　　号：24

期　　号：10

起止页码：1465-1471

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、RSC、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：本文基于近红外光谱结合化学模式识别中的偶合人工神经网络(ANN-ANN)法研究了一种快速、简单和低成本检测STR基因型的方法。选择STR基因座D5S818的差异较小的10-11、11-11、11-12与11-13基因型作为研究对象,将这四个基因型样本进行标准的PCR扩增并采集PCR产物的近红外光谱,以近红外光谱为判别变量,以其中一个ANN(rich-information-extracted ANN,RIE-ANN)用于提取建立判别模型的富信息变量,另一个ANN(discriminant-model-built ANN,DMB-ANN)即用于模型建立。ANN-ANN的网络结构为:338-30-338(RIE-ANN)和30-8-4(DMB-ANN)。对于校正集的校正均方根误差为0.0148,预测集为0.0127,预测准确率达到100%。成功实现了基于近红外光谱对STR基因型的快速、简单和低成本检测。

关 键 词：短串联重复序列 近红外光谱 人工神经网络 基因分型

分 类 号：O657.3]