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甘南牦牛H-FABP基因CDS区多态性及生物信息学分析
Polymorphism and bioinformatics analysis of CDS in H-FABP gene in Gannan yak
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃兰州730070
基 金:国家自然科学基金项目(31160451);甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目(GNSW-2010-02);国家科技支撑计划课题(2009BAC53B06)
年 份:2012
卷 号:47
期 号:4
起止页码:14-20
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、核心刊
摘 要:应用PCR产物混合样本DNA池法检测甘南牦牛心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因CDS区多态性,并应用生物信息学方法分析甘南牦牛H-FABP蛋白质特性.结果表明:甘南牦牛H-FABP基因CDS区序列与九龙牦牛相同,而与普通牛对比在第3外显子存在*76G>A的同义突变;甘南牦牛H-FABP氨基酸序列没有明显的疏水性区域,也未形成跨膜螺旋区及信号肽,推测其主要在细胞质中发挥生物学作用;甘南牦牛H-FABP基因编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主的mixed型;氨基酸序列与普通牛、山羊、马、人、小鼠、大鼠、鸡、草雀及绿鸭9个物种间同源性较高,与其实际亲缘关系远近一致.
关 键 词:甘南牦牛 H-FABP基因 多态性 生物信息学
分 类 号:S823]
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