期刊文章详细信息
基于PCR-LDR平台的近交系小鼠遗传质量快速检测方法
A rapid detection method of inbred mouse DNA genetic quality based on PCR-LDR platform
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]东华大学生物科学与技术研究所,上海201620 [2]中国科学院上海生命科学研究院,上海200031 [3]上海实验动物研究中心,上海201203
基 金:国家自然科学基金(编号:31171199);上海市创新行动实验动物研究项目(编号:10140900903)
年 份:2012
卷 号:20
期 号:4
起止页码:1-8
语 种:中文
收录情况:CAS、CSCD、CSCD2011_2012、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的建立基于PCR-LDR平台的近交系小鼠SNP快速分型方法,用于检测实验小鼠的遗传质量与品系纯度。方法利用可移植性极高的PCR-LDR技术,以常见近交系小鼠为研究对象,选取了21条染色体上的45个SNP位点,分别设计引物和探针,经过筛选和验证,建立了多重PCR-LDR(polymerase chain reaction and ligase detection reaction,PCR-LDR)分型方案。结果四组多重PCR-LDR可实现45个SNP位点的基因分型,其中43个、44个与45个SNP在样本中的检出率分别为100%、90.9%与36.4%。所有样本经分型确定为纯合体,并得到了常见近交系小鼠SNP位点信息。结论实现了常见近交系小鼠快速、高通量的基因分型,可用于遗传质量检测和品系鉴定。
关 键 词:遗传质量检测 近交系小鼠 单核苷酸多态性位点 聚合酶链式反应 链接酶检测反应
分 类 号:Q95-33]
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