期刊文章详细信息
用于荔枝qPCR分析的内参基因克隆及稳定性分析
Cloning and Stability Analysis of Reference Genes for Expression Studies by Quantitative Real-Time PCR in Litchi
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]华南农业大学园艺学院,南方果树生理研究室,广东广州510642 [2]中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,广东湛江524091 [3]海南省农业科学院果树研究所,海南海口571100
基 金:国家自然科学基金(30971985);国家科技支撑计划项目(2006BAD 0lAl705);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-33)
年 份:2012
卷 号:33
期 号:3
起止页码:301-306
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:利用基因克隆和测序,从‘妃子笑’荔枝果皮中获得了β-Actin、GAPDH和18S rRNA 3个qPCR分析常用的内参基因全长序列,其长度分别为1 273、1 368和1 712 bp;3个基因与其他物种高度同源,氨基酸序列相似性均超过了98%.在此基础上,结合已报道的UBQ、eEF和25S rRNA 3个常用的内参基因,对β-Actin、GAPDH、18S rRNA,UBQ、eEF和25S rRNA 6个常用内参基因在荔枝果实发育不同阶段和外源生长调节剂处理后表达稳定性进行了分析,同时比较了geNorm、Norm Finder和BestKeeper 3种不同算法的差异.结果表明:以上6个基因中,β-Actin基因在3种不同算法下均保持了较好的表达稳定性.
关 键 词:荔枝 qPCR 内参基因 克隆 稳定性分析
分 类 号:S667.1]
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