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贵州黑山羊独立生长因子1B基因cDNA克隆与生物信息学分析
Cloning and bioinformatics analysis of GFI1B gene cDNA in the Guizhou Black Goat
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]贵州大学动物科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025 [2]苏州市吴中区金庭动物防疫站,江苏苏州215111
基 金:贵州省农业科技攻关项目[黔科合NY字(2008)3044]
年 份:2012
卷 号:44
期 号:7
起止页码:27-32
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、ZGKJHX、核心刊
摘 要:选择与羊同源性较高的牛独立生长因子1B(GFI1B)基因序列设计特异性引物,提取贵州黑山羊脾脏总RNA,通过RT-PCR技术对GFI1B基因进行克隆测序及序列分析。结果表明:首次克隆了贵州黑山羊GFI1B基因cDNA序列996 bp,GenBank登录号为JN662390,编码331个氨基酸。贵州黑山羊GFI1B基因与牛的同源性高达97.0%。聚类分析显示:哺乳动物、禽类和两栖类各为一类。生物信息学分析表明:山羊GFI1B分子包括1个低组分复杂性区域、6个锌指结构域ZnF-C4。同时,预测结果还表明GFI1B分子不包含信号肽序列且没有跨膜螺旋结构域,26个磷酸化位点,蛋白糖基化位点有7个。
关 键 词:贵州黑山羊 GFI1B 克隆 序列分析
分 类 号:S813.2]
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