文献类型：期刊文章

作　　者：辛天怡[1] 姚辉[1] 罗焜[1] 向丽[1] 马晓冲[1] 韩建萍[1] 林余霖[1] 宋经元[1] 陈士林[1]

机构地区：[1]中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室,100193

出　　处：《药学学报》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(81130069);国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(2012AA021602);教育部长江学者和创新团队发展计划(IRT1150)

年　　份：2012

卷　　号：47

期　　号：8

起止页码：1098-1105

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、DOAJ、EMBASE、IC、IPA、JST、PUBMED、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为验证DNA条形码鉴定的稳定性与准确性,本文选用羌活药材作为研究对象,对31份样本提取基因组DNA,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列并进行双向测序,所得序列经CodonCode Aligner拼接后,采用MEGA5.0软件与其混伪品进行序列比对,计算种内和种间距离,构建邻接树(neighbor-joining tree,NJ Tree)。ITS2序列采用基于隐马尔可夫模型(hidden Markov model,HMMer)的注释方法获得。结果表明,羌活药材ITS序列长度为603～604 bp,ITS2序列长度均为228 bp,羌活药材ITS/ITS2序列单倍型与其基原植物叶片序列一致。两种基原植物ITS/ITS2序列种内平均kimura 2-parameter(K2P)遗传距离均远远小于其与混伪品的种间平均K2P遗传距离;NJ树结果显示羌活、宽叶羌活与其混伪品均可明显区分,表现出良好单系性。因此ITS/ITS2序列作为DNA条形码能稳定、准确鉴别羌活药材,为保障临床安全用药提供了新的技术手段。

关 键 词：羌活 ITS/ITS2  物种鉴定 稳定性 准确性  

分 类 号：R931]