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DNA条形码序列对9种蒿属药用植物的鉴定
Identification of nine common medicinal plants from Artemisia L. by DNA barcoding sequences
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国医学科学院,北京协和医学院药用植物研究所,濒危药材繁育国家工程实验室,北京100193 [2]天津中医药大学,天津300193
基 金:高等学校博士学科点专项科研基金资助课题(20091106120011)
年 份:2012
卷 号:43
期 号:7
起止页码:1393-1397
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、IPA、JST、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的采用DNA条形码序列对9种常见的蒿属药用植物进行鉴定,为常见蒿属药用植物的鉴定提供分子依据。方法对9种常见蒿属药用植物的4条候选DNA条形码序列(ITS2、rbcL、matK、psbA-trnH)进行PCR扩增和测序,比较各序列的扩增和测序效率,应用BLAST1、Distance方法来评估各序列的鉴定效率。此外,基于MEGA5分析9种常见蒿属药用植物ITS2序列种间K2P遗传距离并构建NJ树。结果除matK外,其余3条片段的PCR扩增和测序效率均为100%,ITS2序列对9种蒿属药用植物的物种水平鉴定成功率最高,为100%,而psbA-trnH、rbcL、matK、matK+rbcL的鉴定成功率(BLAST1法)分别为83.3%、66.7%、54.5%、75%。通过ITS2序列的种间K2P遗传距离及NJ树均能将不同物种全部区分。结论 ITS2序列可以作为鉴定蒿属药用植物的潜在条形码。
关 键 词:蒿属:DNA条形码 ITS2 PCR扩增 遗传距离
分 类 号:R282.12[中药学类]
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