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引起吉林省2011年手足口病流行的肠道病毒71型VP1区基因的特征
Characteristics of gene encoding VP1 region of enterovirus 71 causing epidemic of hand, foot and mouth disease in Jilin Province,China in 2011
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]吉林省疾病预防控制中心吉林省卫生厅病毒重点实验室,长春130062 [2]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京102206 [3]白山市疾病预防控制中心,吉林白山134300 [4]延边州疾病预防控制中心,吉林延吉133000 [5]通化市疾病预防控制中心,吉林通化134000 [6]白城市疾病预防控制中心,吉林白城137000 [7]长春市疾病预防控制中心,长春130033 [8]辽源市疾病预防控制中心,吉林辽源136200 [9]四平市疾病预防控制中心,吉林四平136000 [10]吉林市疾病预防控制中心,吉林吉林132000
基 金:吉林省人社厅2010年度留学回国人员科技创新创业项目(2010-27);吉林省卫生厅2010年拔尖创新人才培养对象资助经费;科学技术部重大专项"传染病监测技术平台"(2009ZX10004-209);国家自然科学基金(30901259)
年 份:2012
卷 号:25
期 号:7
起止页码:821-824
语 种:中文
收录情况:AJ、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的分析引起吉林省2011年手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)流行的肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)VP1区基因的特征。方法对2011年分离自吉林省8个市(州)HFMD病例的35株EV71分离株的VP1编码区基因进行RT-PCR扩增及序列测定,应用Bioedit和MEGA 4.0软件对VP1基因进行同源性和基因亲缘关系分析。结果吉林省2011年的35株EV71分离株均属于C4a基因亚型;其VP1区基因的核苷酸序列同源性在95.9%~100%之间,分属于3个进化枝,形成3个传播链,与2008年安徽阜阳株亲缘关系最近,VP1区基因核苷酸序列同源性达97.6%~99.3%,与2007年的北京株和2003年的浙江株亲缘关系相对较远;2011年吉林省各市中,既存在3个EV71传播链共流行的市,同时监测到2个EV71传播链共流行的市,还发现3个只有单一EV71传播链的市,每个传播链均在5个市流行传播。结论 2011年在吉林省内,3个C4a基因亚型EV71的传播链同时循环传播引起HFMD的流行,未发现优势传播链。
关 键 词:手足口病 肠道病毒A型,人 VP1区 基因特征
分 类 号:R373.2] Q78[基础医学类]
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