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期刊文章详细信息

基于OpenMP的Multi-Critical分子动力学并行算法优化    

Optimization of parallel algorithm for molecular dynamics based on OpenMP and Multi-Critical

  

文献类型:期刊文章

作  者:段振华[1] 白明泽[1,2] 豆育升[1,3]

机构地区:[1]重庆邮电大学高性能计算与应用研究所,重庆400065 [2]电子科技大学计算机科学与工程学院,成都611731 [3]Dept.of Physical Sciences,Nicholls State University

出  处:《计算机应用研究》

基  金:国家自然科学基金资助项目(21073242)

年  份:2012

卷  号:29

期  号:7

起止页码:2432-2434

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2011、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、INSPEC、JST、RCCSE、UPD、ZGKJHX、ZMATH、核心刊

摘  要:为提高分子动力学模拟在多核共享内存式服务器上的运算速度,在现有的分子动力学并行算法基础上提出了Multi-Critical算法。该算法使用手动划分力矩阵的方法,使多个线程进入不同名的临界区,并使用分块叠加的方法优化了并行算法,提高了并行效率。实验结果表明,对比之前的Critical算法,该算法的加速比和并行效率均有较大幅度的提高。

关 键 词:分子动力学 并行计算 多核处理器 开放式多处理  临界区  

分 类 号:TP301.6]

参考文献:

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引证文献:

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同被引文献:

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