期刊文章详细信息
基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构
Genetic Diversity and Population Structure of Important Chinese Maize Inbred Lines Revealed by 40 Core Simple Sequence Repeats (SSRs)
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081 [2]西南大学玉米研究所,重庆400715 [3]北京市农林科学院玉米研究中心,北京100097 [4]中国农业大学国家玉米改良中心,北京100094
基 金:国家“973”计划项目(2009CB118401);农业部农作物种质资源保护与利用项目(NB2130135);国家自然科学基金(30730063)
年 份:2012
卷 号:45
期 号:11
起止页码:2107-2138
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、FSTA、IC、JST、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:【目的】选择有代表性的材料进行遗传多样性与群体结构的解析是进行等位基因发掘、复杂性状关联分析、研究,及作物育种实践的重要基础。【方法】利用覆盖玉米全基因组的40个核心SSR标记,采用基于测序的基因型鉴定技术对820份代表中国玉米育种资源种质基础的自交系进行全基因组扫描,通过PowerMarker V3.25与Structure V2.3.3等软件揭示其基因多样性与群体结构。【结果】在820份自交系中,40个SSR标记所检测到的等位变异为10—72个,平均36.87个/位点;基因多样性为0.46—0.9458,平均0.8430;PIC为0.43—0.94,平均0.83。聚类分析表明,K=5时,△K值最大,即这些自交系可以划分成5个类群,依次为兰卡斯特、旅大红骨、塘四平头、瑞德与P群,各类群内平均等位变异与遗传多样性分别为24.23个/位点与0.8145、22个/位点与0.8398、11.8个/位点与0.7054、17.45个/位点与0.7686以及14.65个/位点与0.7495。【结论】中国玉米自交系在育种实践中形成了相对独立的优势类群,蕴含了比较丰富的遗传变异,显示出了较高水平的基因多样性。不同类群之间的遗传多样性水平存在一定的差异,在划分的5个类群中,兰卡斯特与旅大红骨类群的遗传变异相对较丰富,基因多样性相对较高,其次为瑞德与P群,塘四平头相对较低。
关 键 词:玉米 自交系 遗传多样性 群体结构
分 类 号:S513]
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