文献类型：期刊文章

作　　者：刘博[1,2] 邵艳卿[1,2] 滕爽爽[1,2] 柴雪良[1,2] 肖国强[1,2]

机构地区：[1]浙江省海洋水产养殖研究所,温州325000 [2]浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室,温州325000

出　　处：《海洋与湖沼》

基　　金：温州市科技兴海项目;S20080019号;浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室开放基金;J2010009号;浙江省海水养殖重点科技创新团队资助;2010R50025号;国家贝类产业技术体系浙江综合试验站资助;CARS-48号

年　　份：2012

卷　　号：43

期　　号：1

起止页码：132-137

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：采用CAP3软件对NCBI上的5296条缢蛏ESTs序列进行了微卫星特征分析。结果表明,经拼接、去冗得到非冗余EST序列3453条,含SSR位点的EST序列267条,共307个SSR位点,检出率为8.89%,平均每6.83kb出现1个SSR位点。设计了40对EST-SSR引物并进行PCR扩增,29对引物能扩增出理想的PCR产物,其中多态性引物14对。利用14对多态性引物分析了乐清湾缢蛏遗传多样性,共检测到等位基因数(Na)61个,每个位点的等位基因数为2—12个。二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占15.96%、37.13%和35.50%。乐清湾缢蛏群体观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)分别为0.569、0.490和0.449,表明乐清湾缢蛏遗传多样性较丰富。

关 键 词：缢蛏 表达序列标签(EST)  简单重复序列(SSR)  

分 类 号：S968.3]