文献类型：期刊文章

作　　者：史洁[1] 尹佟明[1] 管宏伟[1] 戴晓港[1] 陈金慧[1] 施季森[1]

机构地区：[1]南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室,江苏南京210037

出　　处：《南京林业大学学报（自然科学版）》

基　　金：国家林业局林业公益性行业科研专项项目(200904002)

年　　份：2012

卷　　号：36

期　　号：2

起止页码：47-51

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、INSPEC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：对油茶基因组约10%覆盖度的DNA序列进行微卫星查找,共获得11 344个重复单元长度为1～6碱基的微卫星。在此基础上,通过对这些微卫星序列分析发现:在油茶基因组中长度为二核苷酸的微卫星重复单元最为丰富,占27.1%;在单碱基重复和二碱基重复这两种类型中,最主要的优势重复单元分别是A/T以及AT/TA、AG/TC。三碱基、四碱基、五碱基重复类型中,(AAN)n、(AAAN)n和(AAAAN)n为对应的优势重复单元,这些优势重复单元中富含碱基A和T。油茶基因组中变异程度高的微卫星(长度≥20 bp)约占11.7%。分析还发现,除单核苷酸重复微卫星外,油茶基因组微卫星长度的变异速率与重复单元长度呈负相关,即油茶基因组中长度较短的微卫星变异速率较快,而较长的重复单元变异速度较慢,相对较为稳定。

关 键 词：油茶 微卫星 重复单元  长度变异  

分 类 号：S722]