文献类型：期刊文章

作　　者：韦传宝[1,2] 华俊雅[1] 杨宇[1] 隗洋洋[1] 史利利[1]

机构地区：[1]皖西学院,生物与制药工程学院,安徽六安237012 [2]安徽省植物生物技术实训中心,安徽六安237012

出　　处：《广西植物》

基　　金：安徽省教育厅自然科学基金重点项目(KJ2011A272,KJ2010A328)~~

年　　份：2012

卷　　号：32

期　　号：2

起止页码：231-237

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：设计特异性引物PCR扩增了六安大蒜病样中的韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)、洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)和胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的全长CP基因,插入到pGEM-T载体并测序。分别比较3种病毒CP基因种内变异性和种间亲缘关系。结果表明LYSV六安分离物CP基因由864个碱基组成,与Genbank上已报道的68个LYSV不同分离物CP基因的核苷酸序列同源性为76.12%～84.31%;OYDV的CP基因由771个碱基组成,与Genbank上已报道的86个OYDV不同分离物同源性为81.06%～90.40%;SYSV的CP基因由774个碱基组成,与Genbank上已报道的11个SYSV不同分离物CP基因同源性为88.63%～94.32%;从分析结果来看,LYSV的CP基因不同分离物之间变异性较大,OYDV CP变异性不大,SYSV变异性很小;3种病毒都有1个以上的宿主,病毒种内不同宿主分离物之间CP序列差异很小。进化分析显示OYDV和SYSV的CP基因亲缘性较近并成簇,LYSV的CP基因与OYDV和LYSV的CP基因亲缘性较远。

关 键 词：韭葱黄条病毒  洋葱黄矮病毒  胡葱黄条病毒  CP基因 序列分析  

分 类 号：S436.421]