文献类型：期刊文章

作　　者：张体付[1] 葛敏[1] 韦玉才[2] 赵涵[1]

机构地区：[1]江苏农业科学院农业生物技术研究所,南京210014 [2]南京农业大学,南京210095

出　　处：《玉米科学》

基　　金：江苏省农业科技自主创新资金项目[cx(10)435]

年　　份：2012

卷　　号：20

期　　号：2

起止页码：64-68

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：InDel作为重要的遗传标记已被广泛用于作物连锁图谱的构建及多样性研究。通过生物信息学方法从玉米全基因组水平进行InDel标记的挖掘并对其在玉米杂交种纯度鉴定中的应用进行分析,根据B73全基因组序列(第二版)及Mo17的二代电子拼接序列发现了40 000多个InDel位点,其中约有11 400个含有InDel位点的序列可用于特异性引物的开发。新发展的143个代表基因(<1 kb)或基因内部的功能性InDel标记在B73及Mo17间得到了验证并用于玉米杂交种纯度的鉴定。经过分析,共有13个共显性InDel标记在6个杂交种亲本间表现出明显的长度多态(>50 bp)。结合玉米子粒DNA快速提取方法,利用这些共显性InDel标记对6个杂交种1 400多个样本纯度进行鉴定,结果显示该方法可以快速、准确、经济地鉴定玉米杂交种纯度。

关 键 词：玉米 INDEL 分子标记 杂交种 纯度鉴定

分 类 号：S513.035]