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淮河水系日本沼虾群体遗传结构和系统演化的线粒体COI序列分析
Genetic Structure and Phylogeography of Natural Macrobrachium nipponense Populations in Huaihe River Based on Mitochondrial COI Sequence
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]上海海洋大学省部共建水产种质资源创新与利用重点实验室,上海201306 [2]江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室淮阴师范学院,淮安223300
基 金:国家自然科学基金项目(No.31001111);农业部水产种质资源与利用重点开放实验室项目(No.KFT2008-3);江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室开放课题(No.HZHL0803);江苏省苏北科技发展计划项目(No.BN2009036)
年 份:2012
卷 号:47
期 号:2
起止页码:73-84
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:测定了淮河水系17个日本沼虾(Macrobrachium nipponense)野生群体共248个个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)部分序列,获得623 bp核苷酸片段,包括48个变异位点,定义了31个单倍型,共享单倍型有12个,整体单倍型多样性和平均核苷酸多样性均处于中间水平。AMOVA分析表明,17个群体间的遗传分化系数Fst=0.041 3(P<0.05),群体间遗传分化较小。Kimura 2-paramter遗传距离在五河与焦岗湖、花家湖及瓦埠湖群体间最大,为0.014,在高邮和邵伯湖群体之间最小,为0.003。MP系统树与单倍型进化网络关系图具有较高的一致性,31个单倍型被分为3个进化枝,其中一个进化枝主要以下游群体为主,另外2个进化枝主要以中游群体为主。群体中性检验、错配分析表明,淮河日本沼虾近期曾经历过种群扩张。
关 键 词:日本沼虾 细胞色素氧化酶亚基I 遗传结构 系统演化 淮河
分 类 号:S917.4[水产类]
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