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期刊文章详细信息

苹果MdGLRs家族基因生物信息学鉴定和表达分析    

Bioinformatics and Expression Analysis of Apple MdGLRs Genes Family

  

文献类型:期刊文章

作  者:罗华[1] 胡大刚[1] 张连忠[1] 郝玉金[1]

机构地区:[1]山东农业大学园艺科学与工程学院,国家苹果工程技术研究中心,农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,山东泰安271018

出  处:《园艺学报》

基  金:国家‘863’计划项目(2011AA100204);山东省水果产业体系和农业良种工程项目

年  份:2012

卷  号:39

期  号:3

起止页码:425-435

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊

摘  要:利用生物信息学策略对苹果MdGLRs家族基因编码蛋白的氨基酸序列的基本特征、二级结构、跨膜区域、亲疏水性、基因亚细胞定位及保守结构域进行了预测和分析,与拟南芥AtGLRs家族的20个基因进行了氨基酸序列比对和进化树分析,并对这些基因在不同营养生长器官中进行了表达分析。结果表明,苹果MdGLRs家族包含32个基因,分为3个亚族,大部分基因编码800个氨基酸以上,多含有3个跨膜区域,二级结构主要以α–螺旋、无规则卷曲、折叠延伸链为主;亚细胞定位预测发现,MdGLRs蛋白主要定位在内质网和质膜上;MdGLRs蛋白的保守结构域是S1-M1-M2-M3-S2-M4;大多数基因在根、茎、叶中普遍都有表达,在叶中的表达量最高。

关 键 词:苹果 谷氨酸受体 MdGLRs家族基因  序列分析  生物信息学 表达分析  

分 类 号:S661.1]

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