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中国人HIV-1感染相关的基因CCR5多态性检测和不同方法提取的基因组DNA的比较
Comparison of Efficient Identification of the HIV - 1 Associated CCR5 Gene Polymorphism in Genomic DNA Purified by Differnet Extraction Means from Chinese Individuals
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]解放军302医院传染病研究所,北京市100039 [2]美国纽约大学西奈山医学院肿瘤研究中心
基 金:国家自然科学基金资助项目(课题号:39770683)
年 份:2000
卷 号:6
期 号:1
起止页码:5-8
语 种:中文
收录情况:普通刊
摘 要:目的 检测中国人基因组中HIV-1感染相关的特异性协同受体(CCR5)的基因多态性和比较提取人基因组DNA方法的优缺点。方法 我们分别用常规法和柱层析法从1219名中国人外周血PBMC中提取基因组DNA样品,对纯化后的DNA样品质量进行定性和定量分析;并对其基因组DNA中CCR5基因进行了PCR、Southern杂交和直接DNA测序等分析。结果 在中国人基因组中,检测的CCR5基因多态性是wt/wt 1 210例、wt/△32 3例,未检测到CCR5△32/△32纯合子突变,CCR5等位基因突变率为0.125%。常规法提取的基因组DNA所需的外周静脉血多(5ml);DNA的量较少且不稳定;操作步骤复杂。相反,QIAamp Boold Kit柱层析法提取DNA仅需要外周血200μl,可稳定地获得一定量的DNA,操作简便。结论 首次报道了中国人CCR5等位基因突变率是0.125%,提示我国绝大多数人群对嗜巨细胞HIV-1病毒的遗传易感性较高;同时证实试剂盒法提取的DNA更适合于CCR5基因多态性分析。
关 键 词:CCR5基因 DNA 艾滋病 HIV-1 基因多态性
分 类 号:R512.91]
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