文献类型：期刊文章

作　　者：刘峰[1,2] 王运生[3,2] 田雪亮[2,4] 茆振川[2] 邹学校[1] 谢丙炎[2]

机构地区：[1]湖南省农业科学院蔬菜研究所,长沙410125 [2]湖南农业大学生物安全科学技术学院,长沙410128 [3]中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081 [4]河南科技学院,河南新乡453003

出　　处：《园艺学报》

基　　金：国家重点基础发展计划项目(2009CB119000);国家自然科学基金项目(31101425);国家大宗蔬菜产业技术体系项目(CARS-25-B-01);公益性行业(农业)科研专项(201103018)

年　　份：2012

卷　　号：39

期　　号：1

起止页码：168-174

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2011、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：利用SSR检索程序从两个辣椒转录组共221037条unigenes(97.3Mb)中筛选得到17319个SSR位点(7.83%),其发生频率为1/56kb。其中以单核苷重复基序为主导类型,占总SSR的56.30%;其次是二、三核苷酸重复基序,其出现频率分别为19.16%和23.18%。对所有含SSR位点EST序列设计的10468对引物进行E-PCR多态性检测,获得1538对E-PCR多态性引物。随机选取20对引物进行验证,其中7对(36.84%)在10个不同类型辣椒材料中表现出多态性,PIC值范围为0.33～0.89,平均为0.67,将10个辣椒材料分为3类。这些潜在的多态性EST-SSR的开发为辣椒遗传多样性分析、图谱构建提供了更丰富的候选分子标记。

关 键 词：辣椒 转录组 EST-SSR

分 类 号：S641.3]