文献类型：期刊文章

作　　者：陈涛[1,2] 史妍茹[1] 尤平[1]

机构地区：[1]陕西师范大学生命科学学院,西安710062 [2]桂林理工大学资产管理处,桂林541004

出　　处：《动物分类学报》

基　　金：中央高校基本科研业务费专项资金资助(GK201002044) )~~

年　　份：2012

卷　　号：37

期　　号：1

起止页码：10-19

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：利用麦穗鱼Pseudorasbora parva和相关鱼类的部分线粒体基因序列,设计出2对长批引物和30对短批引物,采用基于长PCR的2次PCR扩增法测定并注释麦穗鱼线粒体基因组全序列。结果表明,麦穗鱼线粒体基因组长16600bp,A+T含量为58.9%,37个基因位置及组成与其它硬骨鱼一致,均由13个蛋白编码基因、22个tRNA、2个rRNA基因和1个控制区(D-loop)组成。其中L链仅含8个tRNA(Pro、T yr、Ser、Ala、Asn、Cys、Glu、Gln)及ND6基因,其余基因皆由H链编码。基因排列紧密,间隔序列共计13处64bp,长度从1～32bp不等;基因重叠区7处23bp,重叠碱基数在1～7bp之间。13个蛋白编码基因中,除COI起始密码子为GTG外,其余均以ATG为起始密码子;有8个基因(ND1、ND2、COI、ATP6、ATP8、ND4L、ND5、ND6)3'端有完全的TAA或TAG终止密码子,其它5个基因终止密码子为不完整的TA(ND3和ND4)或T(COⅡ,COⅢ,Cyt b)。除tRNASer(AGY)外,其余21个tRNA基因的二级结构均为典型的三叶草结构。预测的lrRNA二级结构共有6个结构域,53个茎环结构,srRNA二级结构包含43个茎环结构。控制区(D-loop)存在3个结构区:终止序列区(TAS)、中央保守区(CSB-F、CSB-D)和保守序列区(CSB-1、CSB-2、CSB-3),其中TAS与DNA复制终止相关,出现茎环结构。

关 键 词：麦穗鱼 线粒体基因组 rRNA二级结构  控制区

分 类 号：Q75]