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丹参肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆与生物信息学分析
Bioinformatics and Expression Analysis of Cinnamoyl-CoA Reductase Gene from Salvia miltiorrhiza Bunge
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]教育部药用资源与天然药物化学重点实验室,西北濒危药材资源开发国家工程实验室,陕西师范大学生命科学学院,西安710062 [2]西安铁一中,西安710054
基 金:国家自然科学基金(31000134);陕西师范大学研究生培养创新基金(2011CXS034)
年 份:2011
卷 号:31
期 号:10
起止页码:1963-1968
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:分析丹参转录组数据库,获得一条新的肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)基因,命名为SmCCR-2(GenBank注册号为JF784010)。该基因包含一个长为966 bp的完整开放读码框,编码321个氨基酸残基。生物信息学分析显示,SmCCR-2编码的蛋白具有NWYCY基序,属于NABD_Rossmann超家族,相对分子量为35.80 kD;预测SmCCR-2为中性亲水的稳定蛋白,存在跨膜结构域。实时荧光定量PCR结果表明,SmCCR-2基因在丹参各组织都有表达,茎中表达量最高。其表达受到病原菌的影响,表明SmCCR-2基因可能与植物防御反应有关。
关 键 词:丹参 SmCCR-2 生物信息学分析 表达模式
分 类 号:Q785]
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