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期刊文章详细信息

丹参肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆与生物信息学分析    

Bioinformatics and Expression Analysis of Cinnamoyl-CoA Reductase Gene from Salvia miltiorrhiza Bunge

  

文献类型:期刊文章

作  者:陈尘[1] 王政军[1] 曹鑫林[2] 王喆之[1]

机构地区:[1]教育部药用资源与天然药物化学重点实验室,西北濒危药材资源开发国家工程实验室,陕西师范大学生命科学学院,西安710062 [2]西安铁一中,西安710054

出  处:《西北植物学报》

基  金:国家自然科学基金(31000134);陕西师范大学研究生培养创新基金(2011CXS034)

年  份:2011

卷  号:31

期  号:10

起止页码:1963-1968

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:分析丹参转录组数据库,获得一条新的肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)基因,命名为SmCCR-2(GenBank注册号为JF784010)。该基因包含一个长为966 bp的完整开放读码框,编码321个氨基酸残基。生物信息学分析显示,SmCCR-2编码的蛋白具有NWYCY基序,属于NABD_Rossmann超家族,相对分子量为35.80 kD;预测SmCCR-2为中性亲水的稳定蛋白,存在跨膜结构域。实时荧光定量PCR结果表明,SmCCR-2基因在丹参各组织都有表达,茎中表达量最高。其表达受到病原菌的影响,表明SmCCR-2基因可能与植物防御反应有关。

关 键 词:丹参 SmCCR-2  生物信息学分析 表达模式  

分 类 号:Q785]

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