文献类型：期刊文章

作　　者：李玲[1] 傅达奇[2] 朱毅[2] 田慧琴[2] 罗云波[2] 朱本忠[2]

机构地区：[1]天津农学院食品科学系,天津300384 [2]中国农业大学食品科学与营养工程学院食品生物技术实验室,北京100083

出　　处：《生物技术通报》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(30871741;30972037)

年　　份：2011

卷　　号：27

期　　号：12

起止页码：166-170

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：以粉红期番茄果实为材料,用含不同浓度甲醛的缓冲液交联DNA和蛋白质,利用超声波将其染色质随机断裂成大小为200-1 000 bp的片段,用RIN蛋白的特异性抗体免疫沉淀与RIN蛋白结合的DNA片段,然后解交联和纯化DNA片段,最终用普通PCR试验和测序验证与转录因子RIN结合的DNA序列。结果表明,适用于番茄果实的最佳ChIP试验条件为:用1%甲醛溶液交联DNA和蛋白质的复合物;用20%功率,工作6 s,间隔10 s,脉冲3次超声破碎该复合物,可以得到适当大小的片段,用于后续的试验。普通PCR和测序验证结果证明转录因子RIN与LeACS2和LeACS4启动子区域的CArG box序列结合。

关 键 词：染色质免疫共沉淀技术  转录因子RIN  LeACS2基因  LeACS4基因  番茄果实

分 类 号：Q943[植物生产类]