文献类型：期刊文章

作　　者：杨华[1,2] 陈琪[1] 韦朝领[1] 史成颖[1] 方从兵[1,3] 宛晓春[1]

机构地区：[1]安徽农业大学农业部茶及药用植物安全生产重点开放实验室,合肥230036 [2]安徽农业大学理学院,合肥230036 [3]安徽农业大学园艺学院,合肥230036

出　　处：《安徽农业大学学报》

基　　金："十二五"国家科技支撑计划(2011BAD01B01);教育部;农业部重点实验室开放基金项目(ltbb201102042)共同资助

年　　份：2011

卷　　号：38

期　　号：6

起止页码：882-886

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：利用茶树全转录组的高通量测序获得的127 094条Unigenes来发掘茶树转录组SSR功能性标记。在这些序列中共搜索出12 242个SSRs,分布于10 325条Unigenes中,出现频率为9.63%。茶树转录组SSRs的平均长度为16 bp,平均分布频率是1/3.68 kb。在茶树转录组的SSRs中,二核苷酸重复是主要的类型,占总SSRs的63.78%。茶树转录组SSRs共包含181种重复基元,二核苷酸重复基元CT/AG和TC/GA是优势重复基元类型,分别占总SSRs的23.84%和23.58%。同时对这些SSR的可用性进行了评价。

关 键 词：茶树 转录组 SSR信息  

分 类 号：S571.1]