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泥鳅线粒体DNA控制区结构分析及遗传多样性研究
Structure of mitochondrial DNA control region and genetic diversity of Misgurnus anguillicaudatus
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]安徽农业大学动物科技学院,安徽合肥230036 [2]安徽省怀远县水产技术推广中心,安徽怀远233400 [3]安徽省怀远县渔业科技发展有限责任公司,安徽怀远233400
基 金:安徽省科技攻关计划项目(07010302147)
年 份:2011
卷 号:7
期 号:5
起止页码:55-62
语 种:中文
收录情况:AJ、CAB、CAS、CSA、FSTA、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:采用PCR和DNA测序技术对4个泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)群体的线粒体DNA控制区序列进行比较,研究其遗传多样性和控制区的结构。结果显示,用于分析的线粒体DNA控制区片段序列为918~920 bp。32个序列中共发现了56个多态位点,其中32个转换位点,19个颠换位点,5个转换与颠换同时存在的位点,定义了32种单倍型。同时对控制区结构进行分析,识别了其终止序列区(ETAS)、中央保守区(CD)和保守序列区(CSB)的关键序列。4个地理群体的单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.992、0.012和10.698。群体间的平均Kimura双参数遗传距离(Kimura 2-parameter distance,K2-P)、遗传分化指数(Fst)、基因交流值(Nm)和分子方差分析(AMOVA)均表明4个泥鳅群体具有较高的遗传分化,基因交流贫乏。利用核苷酸序列构建的NJ分子系统树揭示4个群体分为2个谱系,除范县群体外,其余各群体间相互交叉聚集。
关 键 词:泥鳅 线粒体DNA控制区 遗传多样性
分 类 号:Q523.8] S917.4[水产类]
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