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期刊文章详细信息

鼻咽癌细胞系CNE2中NPCEDRG基因mRNA剪接变异体分析    

Analysis of NPCEDRGAlternative Splicing Variants in NPC Cell Line CNE2

  

文献类型:期刊文章

作  者:侯德富[1,2,3] 关勇军[2] 关瑞[1,2] 万恂恂[1,3] 李国庆[1,2,4] 欧阳咏梅[2] 余艳辉[2] 陈主初[1,2]

机构地区:[1]中南大学湘雅医院卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室,长沙410008 [2]中南大学肿瘤研究所,长沙410008 [3]湖南师范大学医学院生物化学与分子生物学教研室,长沙410013 [4]南华大学药学与生命科学学院生物科学系,衡阳421001

出  处:《中国生物化学与分子生物学报》

基  金:国家自然科学基金项目(No.30772401)~~

年  份:2011

卷  号:27

期  号:9

起止页码:841-850

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、PUBMED、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的1个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.本研究对CNE2细胞所表达的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体克隆、鉴定,发现NPCEDRG基因至少有7个转录起始位点,其中NM_032316的TSS位于ATG上游-85 nt处,AF538150和AK094248的TSS位于-25 nt处;AF538150不存在第2外显子中6核苷酸序列(3'-TTGCAG-3')的缺失,其CDs为516 bp,编码1种由171个氨基酸组成的蛋白质(而非GenBank中公布的CDs为510 bp,1种由169个氨基酸组成的蛋白质).本研究成功克隆得到1种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体V2,其TSS位于-23 nt处,其CDs为297 bp,编码1种由98个氨基酸组成的蛋白质.

关 键 词:NPCEDRG基因  mRNA剪接变异体  5'-RACE  3'-RACE  RT-PCR

分 类 号:Q71] R73]

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