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大鳞副泥鳅mtDNA Cytb基因序列分析及分子系统发育研究
Analysis of Mitochondrial DNA Cytochrome b Gene Sequence and Molecular Phylogeny in Paramisgurnus dabryanus Sauvage
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]安徽农业大学动物科技学院,安徽合肥230036 [2]怀远县水产技术推广中心,安徽怀远233400 [3]怀远县渔业科技发展有限责任公司,安徽怀远233440
基 金:安徽省科技厅资助项目(07010302147)
年 份:2011
卷 号:30
期 号:9
起止页码:551-554
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、FSTA、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:对15尾大鳞副泥鳅的线粒体细胞色素b基因进行PCR扩增和正反测序,获得长度为1140 bp的细胞色素b基因同源片断。所有序列中共检测到15种单倍型,序列中共出现81个变异位点,总变异率为7.1%。各单倍型的变异全部是转换或颠换,无插入和缺失,转换/颠换比为6.36。变异位点在3位密码子中的分布呈现偏倚,密码子第3位的变异占总变异的85.18%,而第1和第2位均只占7.41%。A、T、C、G碱基的平均含量分别为27.4%、30.8%、26.5%、15.3%,A+T>C+G。在所得序列中,密码子第1位上4种碱基使用较为均衡;第2位上碱基T的使用率高达41%,碱基G的使用率低至13.2%;第3位上碱基A的使用率为37.9%,而碱基G的使用率仅为7.0%。以红尾副鳅为外群用邻接法构建分子系统进化树。结果显示,在系统地位上大鳞副泥鳅与黑龙江泥鳅有较近的亲缘关系。
关 键 词:大鳞副泥鳅 细胞色素B基因 系统发育
分 类 号:Q523.8]
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引证文献:
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