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期刊文章详细信息

肠道病毒71型山东临沂分离株全基因组序列分析    

Sequence analysis for full length genomes of human enterovirus 71 strains isolated in Linyi, Shandong Province

  

文献类型:期刊文章

作  者:温红玲[1] 郝树彬[2] 高峰[3] 赵丽[1] 司鲁莹[1] 袁晓晶[1] 王东旭[1] 王志玉[1]

机构地区:[1]山东大学公共卫生学院病毒学研究室,实验畸形学教育部重点实验室,济南250012 [2]山东省医疗器械质量监督检验中心 [3]山东临沂市人民医院

出  处:《中华微生物学和免疫学杂志》

基  金:国家自然科学基金(30901265);教育部博士点基金新教师基金(20090131120068);山东大学公共卫生学院青年人才创新基金

年  份:2011

卷  号:31

期  号:7

起止页码:603-608

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的自1例死亡患儿的标本中分离EV71,并分析其全基因组序列特点,研究其基因序列的改变是否与其神经毒力有关。方法咽拭子标本采自山东临沂市人民医院1例死亡患儿,在人横纹肌瘤细胞(RD)上分离EV71,分段扩增获得EV71的全序列,用BLAST、Bioedit和MEGA4进行序列分析。结果获得1株EV71分离株SDLY107,基因组全长7405bp,全基因组核苷酸序列与2008年的阜阳株Fuyang.Anhui.P.R.C/17.08/2同源性最高,为98.6%,与原型株BrCr/70的同源性为80.O%,与神经毒型株MS/87的同源性为86.5%。系统进化分析表明,SDLY107与中国大陆的北京株、河南株、广西株、深圳株、兰州株、阜阳株、重庆株、浙江株的亲缘关系较近,按照传统的VP1基因分型方法,可归为C4亚型,是近年来我国大陆流行的主要基因亚型。氨基酸序列分析发现,SDLY107与其他毒株相比,有2个特有的突变(E947D,K1873R)。结论SDLY107分离株属于C4亚型,氨基酸突变E947D和K1873R可能与EV71的致病性有关。

关 键 词:手足口病 肠道病毒71型 序列分析  

分 类 号:R72]

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