期刊文章详细信息
玉米黑粉菌CYP51稀有密码子和mRNA二级结构分析及与杀菌剂戊唑醇分子对接 ( SCI收录)
Analysis of Rare Codon and mRNA Structure About Ustilago maydis CYP51 and Molecular Docking With Fungicide Tebuconazole
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]华中师范大学生命科学学院遗传调控与整合生物学湖北省重点实验室,武汉430079 [2]青海大学农林科学院园艺研究所,西宁810016 [3]华中科技大学生命科学与技术学院,武汉430074
基 金:国家自然科学基金(30771429;31071653);国家高技术研究发展计划(863)(2007AA05Z417);教育部博士点基金(20060511002)资助项目~~
年 份:2011
卷 号:38
期 号:8
起止页码:751-758
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、SCI(收录号:WOS:000294241800011)、SCI-EXPANDED(收录号:WOS:000294241800011)、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:通过截短玉米黑粉菌CYP51(P450-14DM,UmCYP51)基因(去除编码跨膜区部分)和选取不同的表达载体,构建了9种重组表达质粒,在大肠杆菌中进行UmCYP51基因的表达,发现只有BL21(DE3)/pET32-Um-35重组表达工程菌获得了表达.对稀有密码子和mRNA翻译起始区二级结构进行分析,结果表明稀有密码子和mRNA翻译起始区二级结构对UmCYP51蛋白的表达都有影响.适用于稀有密码子表达的菌株Rosetta(DE3)不利于UmCYP51蛋白的表达;同时只有翻译起始区二级结构自由能值最低的重组载体pET32-Um-35可以表达.为了设计以UmCYP51为靶标的新型抗真菌抑制剂,基于最新解析的真核生物人类的CYP51晶体结构,利用同源模建的方法构建了UmCYP51的三维结构并进行了分子动力学模拟优化.通过与商品化杀菌剂戊唑醇进行分子对接获得了此类抑制剂与UmCYP51的理论结合方式,阐述了戊唑醇分子的杀菌机理,为开发新型的抗真菌抑制剂奠定了基础.
关 键 词:UmCYP51 翻译起始区 稀有密码子 同源模建 分子对接
分 类 号:Q617] Q786
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