期刊文章详细信息
柑橘SCoT分子标记技术体系的建立及其在遗传分析中的应用
Establishment and Application of SCoT Molecular Marker System for Citrus
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]西南大学南方山地园艺学教育部重点实验室,重庆400715 [2]中国农业科学院柑桔研究所,重庆400712
基 金:中央高校基本科研业务费专项(XDJK2009C125);西南大学研究生科技创新基金项目(kb2010011);重庆市重大科技专项(CSTC;2007AB1039;2007AB1040)
年 份:2011
卷 号:38
期 号:7
起止页码:1243-1250
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:采用正交设计方法,对影响柑橘SCoT-PCR反应的Mg2+、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶及模板DNA用量等因素进行优化,建立了适于柑橘的SCoT标记分析体系。20μL反应体系中含有:Mg2+1.5 mmol.L-1,dNTPs 0.35 mmol.L-1,引物0.625μmol.L-1,TaqDNA聚合酶0.25 U,模板DNA 10 ng。最适退火温度为49℃。利用该体系对Wan2橘橙×Li2甜橙的杂交后代及沙田柚四倍体进行分析,扩增条带清晰,扩增产物在150~2 100 bp之间。7个引物在Wan2橘橙、Li2甜橙及其18株杂交后代中共扩增出74条带,多态性条带48条,多态性比率为64.9%,在相似系数0.85处,18株杂交后代可聚为5类,表明其具有较丰富的遗传多样性;11个引物在4株沙田柚四倍体及其二倍体亲本中共扩增出84条带,其中多态性条带46条,多态性比率为54.8%,聚类分析显示5株沙田柚遗传相似系数在0.785~0.880,在相似性系数0.825处可分为3类,3株同源四倍体分别聚在不同的位置,四倍体材料均发生了不同程度的遗传变异。研究结果表明建立的柑橘SCoT体系结果稳定,重复性好,可为柑橘遗传育种提供新的技术支持。
关 键 词:柑橘 目标起始密码子多态性(SCoT) 遗传分析 多倍体
分 类 号:S666]
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