文献类型：期刊文章

作　　者：周晓罡[1,2] 侯思名[3] 陈铎文[1,2,4] 陶南[1,2] 丁玉梅[1,2] 孙茂林[1,2] 张绍松[1,2]

机构地区：[1]云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,昆明650223 [2]云南省农业生物技术重点实验室,昆明650223 [3]昆明学院生命科学与技术系,昆明650031 [4]云南大学生命科学学院,昆明650091

出　　处：《遗传》

基　　金：云南省十一五科技攻关项目(编号:2006NG08);国家自然科学基金项目(编号:31060021);云南省自然科学基金项目(编号:2006C0062M;2008ZC100M)资助

年　　份：2011

卷　　号：33

期　　号：7

起止页码：785-793

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：利用马铃薯晚疫病菌全基因组测序结果,结合计算机技术和生物信息学的方法,对马铃薯晚疫病菌的蛋白进行分析,为明确该病原菌与寄主互作的分子机制奠定基础。文章应用信号肽预测软件SignalP v3.0和PSORT,跨膜螺旋结构预测软件TMHMM-2.0和THUMBUP,GPI锚定位点预测软件big-PI Predictor,亚细胞器中蛋白定位分布预测软件TargetP v1.01,对已经公布的马铃薯晚疫病菌全基因组22 658个蛋白质氨基酸序列进行分析。结果发现,晚疫病菌全基因组编码蛋白中有671个为潜在的分泌型蛋白,占编码蛋白总数的3.0%。其中有45个分泌蛋白有功能方面的描述,其功能涉及细胞代谢、信号转导等方面;此外,还有一些与激发子类似的分泌蛋白,它们可能与晚疫病菌的毒性有关。

关 键 词：晚疫病菌 信号肽 分泌蛋白

分 类 号：S435.32]