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利用单因子和正交设计双重实验法优化鹧鸪茶RAPD-PCR反应体系
Optimization of RAPD-PCR Experimental System in Mallotus oblongifolius(Miq.)Muell.-Arg. Using Dual Experiments of Single Factor and Orthogonal Design
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]海南大学苦丁茶研究所,海口570228
基 金:海南大学校级重点学科专项资金研究课题"海南野生鷓鸪茶资源的种质收集与遗传多样性的RAPD分子标记"
年 份:2011
卷 号:1
期 号:4
起止页码:14-21
语 种:中文
收录情况:JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:为了建立鹧鸪茶RAPD-PCR的优化反应体系,首先通过单因素试验选定其各影响因子比较适宜的浓度范围,再利用正交试验设计方法,对影响鹧鸪茶RAPD-PCR反应的5种因素进行4水平优化试验。并运用SAS软件对试验结果进行了分析,最后确定优化的RAPD-PCR反应体系为:10×Buffer缓冲液2.5μL+Mg2+2.5mmol/L+dNTPs0.2mmol/L+TaqDNA聚合酶1.5U+S28引物0.48mmol/L+80ng模板,定容至25μL。PCR扩增程序为:94℃预变性4min,然后按94℃变性30s,38℃退火45s,72℃延伸120s,进行45个循环,最后72℃延伸10min;16℃保存。该优化的RAPD-PCR反应体系具有良好的稳定性和重现性,可应用于鹧鸪茶不同居群间亲缘关系和遗传多样性分析。
关 键 词:鹧鸪茶 RAPD 影响因子 体系优化
分 类 号:Q785]
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