期刊文章详细信息
吉林省2009年致手足口病流行的肠道病毒71型分离株基因特征分析
Genetic Characteristics of Enterovirus 71 Isolates from Hand Foot and Mouth Disease in Jilin Province of China in 2009
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]吉林省疾病预防控制中心吉林省卫生厅病毒重点实验室,长春130062 [2]白城市疾病预防控制中心,吉林白城137000 [3]北华大学公共卫生学院,吉林吉林132013 [4]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒基因工程国家重点实验室,北京102206
基 金:科学技术部重大专项"传染病监测技术平台"(2009ZX10004-209);吉林省人力资源和社会保障厅留学人员科学技术创新创业择优资助项目(编号2010-27)
年 份:2011
卷 号:17
期 号:3
起止页码:222-226
语 种:中文
收录情况:CAS、PUBMED、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的分析引起吉林省2009年手足口病(Hand Food and Mouth Disease,HFMD)流行的肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)分离株的基因特征。方法选择15株2009年分离于吉林省六个设区的市(州)的HFMD病例的EV71分离株,进行VP1编码区基因全长逆转录-聚合酶链反应扩增、序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件进行同源性、基因亲缘关系分析。结果吉林省2009年的15株EV71分离株均属于C4基因亚型,而且分属于四个相对独立的传播链,其中11株病毒(分离于六个市)属于一个较大的传播链,其余4株形成三个小的传播链。29.5%的吉林省分离株间比对同源性高达99.1%~99.8%,吉林省2009年分离株与安徽省阜阳市2008年以及北京市2008年的流行株间,核苷酸最高同源性分别达到了99.8%和99.7%。结论吉林省2009年至少有四个C4基因型的EV71传播链引起了HFMD的流行,并且有一个EV71优势传播链在几个省以及省内六个市持续传播,引起HFMD的流行;三个小的传播链可能为输入病毒所致。尚未发现在引起HFMD死亡、重症以及轻症的EV71分离株VP1编码区的氨基酸序列呈现规律性的区别。
关 键 词:手足口病 肠道病毒71型 基因特征 VP1编码区
分 类 号:R373.11]
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