文献类型：期刊文章

作　　者：刘莉[1] 马建新[1] 郑毓芳[1] 张仁芳[1] 沈银忠[1] 李莉[1] 陈军[1] 王珍燕[1] 孙富艳[1] 卢洪洲[1,2,3]

机构地区：[1]上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心感染科,上海201508 [2]复旦大学附属华山医院感染科,上海200040 [3]复旦大学上海医学院内科学系,上海200032

出　　处：《微生物与感染》

基　　金："十一五"国家科技重大专项(2008ZX10001-008;2008ZX10001-006);上海市优秀学科带头人A类(08XD14035)

年　　份：2011

卷　　号：6

期　　号：1

起止页码：4-10

语　　种：中文

收录情况：PUBMED、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：本文通过对未经抗病毒治疗患者的人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株进行检测,了解上海地区HIV-1的亚型分布及原发耐药基因变异现状。对118例未经治疗的HIV感染者标本中HIV蛋白酶全长和部分反转录酶基因进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,经DNA测序后,进行系统进化树分析和重组分析,以确定HIV-1基因亚型和重组体,并与斯坦福耐药数据库比对,了解耐药突变位点。使用斯坦福REGAHIV亚型分型工具和美国国立生物技术信息中心(NCBI)HIV亚型分析工具分析,获得118例患者的HIV基因序列,基因分型分别为CRF01_AE重组体57例(48.3%)、B亚型36例(30.5%)、CRF07_BC15例(12.7%)、CRF08_BC7例(5.9%)、C亚型2例(1.7%),亚型间或重组体间二重重组体(B/CRF01_AE)1例(0.8%)。蛋白酶抑制剂(PI)和反转录酶抑制剂相关的耐药基因突变率达54.2%(64/118),其中2例(1.7%)发生PI耐药,基因突变位点:M46L、Q58E。5例(4.1%)对反转录酶抑制剂产生耐药,其中对核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)和非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)的耐药率分别为3例(2.4%)和5例(4.1%)。基因突变位点:NRTI为M41L、D67N、T69I/N/S、K70L、L74V、V75L、V118I、M184V、L210W/F/M/S和T215F;NNRTI为V90I、L100V、K103R/N、V106M/P/I/G、E138G/A、V179E/D/T、Y181C、G190A、H221Y、F227L、K238S和Y318F。结果提示,上海地区HIV毒株以CRF01_AE重组亚型为主,且发现新的重组体,可能出现新重组体流行趋势。PI和反转录酶抑制剂相关的耐药基因突变率较高,且存在高度原发耐药毒株,应加强HIV-1耐药基因变异监测,科学、合理地给予抗病毒治疗。

关 键 词：人类免疫缺陷病毒 基因亚型 重组体 耐药基因突变

分 类 号：R512.91]