文献类型：期刊文章

作　　者：王立新[1] 郑尧[1] 艾闽[1] 杨辉[1] 杨朝霞[1]

机构地区：[1]西北农林科技大学动物科技学院水产科学系,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西杨凌712100

出　　处：《中国生物化学与分子生物学报》

基　　金：陕西省自然科学基金(No.2003C124);西北农林科技大学重点项目(No.01140513)~~

年　　份：2011

卷　　号：27

期　　号：3

起止页码：273-281

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2008、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、PUBMED、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：以健康大鲵背部皮肤为材料,采用Smart技术构建大鲵皮肤cDNA文库,经检测文库容量为1.50×106cfu,文库重组率为98%,插入片段平均长度约为1 kb.通过对大鲵皮肤cDNA文库的随机筛选,分离获得了大鲵肌动蛋白相关2/3复合物亚基-5样蛋白(Arp2/3 complex subunit 5-like,Arpc5l)基因cDNA序列.生物信息学分析表明,大鲵Arpc5l基因全长cDNA为699 bp,包含459 bp的开放阅读框,分子量为17 154.36,等电点(pI)为5.43;该基因编码的Arpc5l蛋白分别在7-29 AA处和44-66 AA处具有跨膜结构域及多种二级结构,且三级结构与Arp2/3 complex家族成员相似.实时定量PCR结果表明,该基因在大鲵皮肤、肌肉、肠、肝、脾、肺、胃以及肾等组织中广泛表达,且在肾、肠、肌肉中的表达量极显著高于其它组织(P<0.01).进化分析结果表明,大鲵Arpc5l氨基酸序列和小鼠(77%)等陆生动物同源性最高,和爪蟾同源性为73%,大鲵处于水生到陆生之间的过渡类型,且与陆生动物的亲缘关系更近.

关 键 词：大鲵  皮肤cDNA文库  大鲵肌动蛋白相关2/3复合物亚基-5样蛋白(Arpc5l)基因  组织表达  进化关系

分 类 号：Q17]