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高致病性PRRSV TJ株和致弱毒TJM株Nsp2测序及结构分析
Sequencing and structure analysis of non-structure protein 2 of porcine reproductive and respiratory syndrome virus TJ and TJM
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国农业科学院特产研究所,吉林吉林132109 [2]北京必威安泰生物科技有限公司,北京100176
基 金:国家"十一五"科技支撑计划(2009BADB4B02)
年 份:2011
卷 号:45
期 号:1
起止页码:86-90
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊
摘 要:参照GenBank中PRRSV VR-2332株全序列设计特异性引物,扩增高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(Por-cine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)TJ株和其致弱毒株TJM株非结构蛋白2(Nonstructure pro-tein 2,Nsp2)编码区,经过基因的扩增、连接、转化、筛选阳性克隆进行核苷酸测序.结果表明,PRRSV TJ株Nsp2长2 850 bp,TJM株Nsp2长2 490 bp.通过序列比较分析,发现Nsp2编码区序列保守性差,TJ株和TJM株Nsp2与VR-2332核苷酸序列的同源性分别为83.6%和82.9%,运用RNAdraw软件对Nsp2编码区RNA的2级结构预测分析表明,分离的高致病性强毒株TJ株和细胞致弱毒株TJM株与经典毒株VR-2332有较大不同,PRRSVNsp2的1级序列的变化导致RNA的2级结构发生构象变化,推测这可能是3个PRRSV毒株致病力不同的原因之一.
关 键 词:猪繁殖与呼吸综合征病毒 非编码区 序列分析
分 类 号:S852.65]
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