文献类型：期刊文章

作　　者：徐容[1] 吴再珍[1] 郭莉萍[2] 鲁辉[1] 葛芝莉[1] 谢洪平[1]

机构地区：[1]苏州大学医学部药学院,江苏苏州215123 [2]重庆科技学院化学化工学院,重庆401331

出　　处：《分析测试学报》

基　　金：国家大学生创新性实验计划资助项目(57315425)

年　　份：2011

卷　　号：30

期　　号：3

起止页码：336-339

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、RCCSE、RSC、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：利用紫外光谱结合支持向量机(SVM)模式识别原理建立了短串联重复序列(STR)的分型方法。以D5S818基因座的10-10、11-13和13-13三个基因型为研究对象,优化了包含该多态性位点的DNA片段的聚合酶链反应(PCR)的扩增条件和紫外光谱检测条件,获得了优化条件下的待测样本紫外光谱。以该光谱为识别变量,建立了该3类基因型的SVM判别模型,有效地克服了光谱共线性,模型预测率100%。该方法无需任何检测前处理,只需一步PCR扩增和紫外光谱检测即可实现STR的基因分型,具有简单、快速、低成本等优点。

关 键 词：短串联重复序列 紫外光谱 支持向量机 基因分型

分 类 号：O433.4] Q524]