文献类型：期刊文章

作　　者：尚明照[1,2] 刘方[2] 华金平[3] 王坤波[2]

机构地区：[1]华中农业大学植物科学技术学院,武汉430070 [2]中国农业科学院棉花研究所,河南安阳455000 [3]中国农业大学农学与生物技术学院,北京100871

出　　处：《中国农业科学》

基　　金：中央级公益性院所基本科研业务费(SJA0901);国家"863"计划项目(2009AA101104);国家自然科学基金(30170501)

年　　份：2011

卷　　号：44

期　　号：2

起止页码：245-253

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、FSTA、GEOBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：【目的】通过分析陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响密码子偏性形成的主要因素。【方法】以陆地棉叶绿体基因组为研究对象,利用Mobyle及其它软件,分析叶绿体50个基因密码子的使用模式。【结果】陆地棉叶绿体基因组密码子GC1与GC2之间的相关系数达到极显著水平,GC3含量最低,与GC12的相关系数为0.14,双尾检验未达到显著水平;单个基因ENC比值多分布在-0.05—0.05;对应性分析,第一轴上显示了10.27%的差异,与GC3、ENC的相关系数分别为0.223和-0.147,均未达到显著水平。【结论】陆地棉叶绿体密码子第三位偏好使用嘧啶,而最优密码子多以A或T结尾;密码子使用模式可能是由选择和突变及其它因素共同作用形成的。

关 键 词：陆地棉 密码子偏性 GC含量 最优密码子  

分 类 号：S562]