文献类型：期刊文章

作　　者：王芬[1] 王海龙[1] 殷丽天[2] 孟晓丽[1] 刘红丽[1] 殷国荣[1]

机构地区：[1]山西医科大学医学寄生虫学研究所,寄生虫学教研室,山西太原030001 [2]山西医科大学生理学系细胞生理学省部共建教育部重点实验室

出　　处：《中国病原生物学杂志》

基　　金：国家自然科学基金项目(No.81071374)

年　　份：2010

卷　　号：5

期　　号：11

起止页码：840-843

语　　种：中文

收录情况：CAB、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的从生物信息学角度分析刚地弓形虫磷酸甘油酸酯变位酶2(TgPGAM2)基因编码蛋白的结构与抗原表位,预测该蛋白的免疫原性。方法利用蛋白分析专家系统(ExPASy)提供的ProtParam、SOSUI、TMHMM、HNN、MotifScan,NCBI上的ORF finder、SignalP、Bcepred等生物信息学在线分析程序,结合Gene Runner、DNAMAN等生物信息学软件,分析、预测TgPGAM2蛋白的理化性质、可溶性、表面可及性?可塑性,信号肽,跨膜区,翻译后修饰位点、亲(疏)水性、二级结构、抗原表位等。结果该蛋白由264个氨基酸组成,分子式为C1345H2097N363O385S11,分子质量为29.865 3 ku,等电点理论值为6.46,波长280 nm时的吸光度(A)值为1.697,半衰期为30 h,有10个表面可及性参数≥1.9的区域、3个亲水性参数得分≥1.9的区域、3个柔韧性参数得分≥2的区域、8个翻译后修饰位点、16个潜在抗原表位,为可溶性表达蛋白。结论刚地弓形虫PGAM2基因编码的Tg PGAM2为可溶性蛋白,具有免疫原性,可作为弓形虫病疫苗候选抗原。

关 键 词：刚地弓形虫 磷酸甘油酸酯变位酶2  生物信息学 抗原表位 免疫原性  

分 类 号：R382.5]