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黄瓜花叶病毒亚组Ⅰ和Ⅱ分离物外壳蛋白基因的序列分析与比较
COAT PROTEIN GENE SEQUENCE ANALYSIS AND COMPARISON OF CUCUMBER MOSAIC VIRUS SUBGROUP Ⅰ AND Ⅱ ISOLATES IN CHINA
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]福建农业大学植物病毒研究所
基 金:福建省自然科学基金
年 份:1999
卷 号:15
期 号:2
起止页码:164-171
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX1996、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:对我国分离的经生物学和血清学鉴定为黄瓜花叶病毒(CMV)亚组Ⅰ和Ⅱ的各一分离物(GB、XB)的外壳蛋白(CP)基因进行了序列分析和比较。以提纯病毒RNA为模板,进行逆转录及PCR扩增,并通过常规基因克隆方法得到插入CP基因片段的重组克隆。对插入GB和XB两个分离物CP基因片段的重组克隆进行全序列测定,结果表明重组克隆序列长分别为777bp和792bp,均只含一个开放读框(ORF),长度为657nt,可编码218个氨基酸;两个分离物的CP基因核苷酸序列同源率为775%,氨基酸序列同源率为826%。与我国已报道的7个CMV分离物的CP基因序列比较,分离物GB的同源率为913%~973%,分离物XB的同源率为766%~784%。与国际上已报道部分CMV株系的CP基因序列相比较,分离物GB与亚组Ⅰ株系有更密切的亲缘关系,而分离物XB则与亚组Ⅱ株系的亲缘关系更密切。
关 键 词:黄瓜花叶病毒 亚组I 亚组Ⅱ 外壳蛋白基因
分 类 号:S436.421.1]
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