期刊文章详细信息
赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析
Differential Expression of Gibberellin-Induced Genes for Stalk Elongation of Sugarcane Analyzed with cDNA-ScoT
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]广西甘蔗研究所,广西南宁530007 [2]广西作物遗传改良生物技术重点开发实验室,广西南宁530007 [3]广西大学广西亚热带生物资源保护利用重点实验室,广西南宁530004 [4]中国农业科学院甘蔗研究中心,广西南宁530007
基 金:国家科技支撑计划项目(2007BAD30B03);广西科技攻关重点项目(桂科攻0782004-3);广西科技攻关项目(桂科能0630006-5F;桂科能0815011);现代农业产业技术体系建设专项资金(nycytx-024-01-15)资助
年 份:2010
卷 号:36
期 号:11
起止页码:1883-1890
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EBSCO、FSTA、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:以甘蔗ROC22为材料,在伸长初期进行叶面喷施200mgL?1浓度的赤霉素为处理,以喷施清水为对照,在不同时间取幼茎样品,用cDNA-SCoT进行基因差异表达分析。结果表明,通过46条引物筛选了约700个cDNA片段,获得差异片段30个。有18个基因片段受赤霉素上调而12个基因片段下调;其中16个TDFs序列和NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,按照其功能可分为6类,即能量与代谢相关基因(占总数的20.0%)、未知功能蛋白(占总数的20.0%)、未知基因(占总数的46.7%)、信号传导相关基因(占总数的6.7%)、转录因子相关基因(占总数的3.3%)和细胞凋亡基因(3.3%)。这说明利用SCoT方法可以进行蔗茎基因差异表达研究,分离到的一些差异片段可能是与甘蔗节间伸长相关的基因。
关 键 词:赤霉素 甘蔗 cDNA-SCoT 差异表达
分 类 号:S566.1]
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