文献类型：期刊文章

作　　者：温晓会[1] 章林溪[2]

机构地区：[1]浙江大学物理系,杭州310027 [2]温州大学物理系,温州325027

出　　处：《物理学报》

基　　金：国家自然科学基金(批准号:20574052;20774066;20974081;20934004)资助的课题~~

年　　份：2010

卷　　号：59

期　　号：10

起止页码：7404-7409

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EI、IC、INSPEC、JST、RCCSE、SCI(收录号：WOS:000283406400106)、SCI-EXPANDED(收录号：WOS:000283406400106)、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZMATH、核心刊

摘　　要：以三叶草型结(即31结)为例,采用分子动力学(MD)方法,研究打结高分子链在外场力作用下穿越微孔的动力学过程.模拟发现,在拉动打结高分子链的过程中,结的大小呈涨落变化,直至最后散结.定性讨论了结的存在对高分子链穿孔速率的影响.在外场力作用下,打结高分子链平均穿孔时间(τ)与链长(N)满足标度关系τ～Nα,其中标度系数α随外场力f增大而增大.对于短链,外场力越大,平均穿孔时间越短;而对于较长的链,外场力越大,平均穿孔时间反而越长.本文还研究了结在高分子链中所处的位置对平均穿孔时间的影响.结点位置不同,高分子链平均穿孔时间也不同.初始时,结越靠近第一个穿孔原子,其平均穿孔时间就越长.通过这些研究,可对打结高分子链(特别是打结DNA)穿越微孔的微观过程有一定认识,从而加深对生物大分子穿孔行为的理解。

关 键 词：分子动力学方法 打结高分子链  穿孔时间  散结

分 类 号：O631.3]