期刊文章详细信息
123株人类免疫缺陷病毒-1重组亚型主要耐药性突变的基因屏障
Genetic barriers of primary drug resistance mutations in 123 recombinant subtype strains of human immunodeficiencyvirus-1
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]广西医科大学公共卫生学院艾滋病研究中心,南宁530021 [2]广西壮族自治区柳州市疾病预防控制中心结核病防治科 [3]广西壮族自治区疾病预防控制中心艾滋病科
基 金:国家自然科学基金资助项目(30760218)
年 份:2010
卷 号:28
期 号:8
起止页码:449-454
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的 比较HIV-1 CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC毒株发生蛋白酶抑制剂(PI)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)和非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)主要耐药性突变的基因屏障,分析不同亚型耐药模式的差异.方法 纳入在广西壮族自治区南宁、柳州两市未经治疗的HIV感染者190例,采集外周静脉血,从血浆中提取HIV-1 RNA,扩增pol区并测序,用系统进化树分析序列的亚型,统计各序列每个主要突变位点由野生型密码子突变为耐药密码子所需的碱基转换和颠换的数量,根据转换与颠换发生概率约2.5:1的规律,将每个转换赋值设为1,每个颠换赋值设为2.5,计算各突变赋值之和,即为基因屏障值,采用Kruskal-Wallis检验法和Nemenyi法比较不同亚型的基因屏障差异.结果 共获得CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC毒株123株.CRF08_BC发生T/S69D的基因屏障低于CRF01_AE和CRF07_BC(χ2=107.501,P<0.01),CRF01_AE和CRF07_BC发生V118I和L210W的基因屏障低于CRF08_BC,CRF07_BC发生V106M的基因屏障低于CRF01_AE和CRF08_BC.结论 在相同的选择压力下,CRF01_AE和CRF07_BC比CRF08_BC易发生V118I和L210W,CRF08_BC比CRF01_AE和CRF07_BC易发生T/S69D,CRF07_BC比CRF08_BC和CRF01_AE易发生V106M.
关 键 词:基因型 抗药性 病毒 突变 HIV-1 蛋白质亚型
分 类 号:R686]
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