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蝴蝶兰叶绿体基因组密码子使用的相关分析
Analysis of Synonymous Codon Usage in Chloroplast Genome of Phalaenopsis aphrodite sub sp. formosana
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]南京晓庄学院生物化工与环境工程学院,南京211171
基 金:南京晓庄学院青年专项(2006NXY)资助
年 份:2010
卷 号:8
期 号:5
起止页码:945-950
语 种:中文
收录情况:CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:通过对蝴蝶兰叶绿体基因组全序列密码子的研究,利用Codonw软件进行统计分析,得出密码子第三位置GC含量为31.41%,明显低于第一位置和第二位置的GC含量,说明密码子第三位置富含AT。从对应分析中得出其叶绿体密码子偏好性与其基因表达水平密切相关,且受到突变和选择压力的共同影响。将高表达优越密码子分析法和高频密码子分析法相结合,确定了20个蝴蝶兰叶绿体的最优密码子。上述结果对今后兰花的分子系统进化和高表达转基因研究具有重要意义。
关 键 词:蝴蝶兰 叶绿体基因组 密码子偏向性
分 类 号:S682.31]
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