文献类型：期刊文章

作　　者：王志刚[1] 朱水荣[1] 张俊彦[1] 阮卫[1] 程洁[2] 贾红宇[3] 包其郁[4] 张政[1]

机构地区：[1]浙江省疾病预防控制中心微生物鉴定和溯源研究室,杭州310051 [2]浙江出入境检验检疫局,杭州310012 [3]浙江大学医学院附属第一医院感染病科,杭州310003 [4]温州医学院生物医学信息研究所,温州325035

出　　处：《中国卫生检验杂志》

年　　份：2010

卷　　号：20

期　　号：9

起止页码：2137-2140

语　　种：中文

收录情况：CAS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的:描述和分类自然发生的霍乱毒素B亚单位DNA和蛋白序列的多态性,及时提供潜在有用的霍乱诊断、疫苗研制和流行病学信息。方法:采用生物信息频谱分析平台,同时包括Clustal W,MEGA和PyMOL分析法,对245个霍乱毒素B亚单位DNA和蛋白序列进行结构和功能及基因分型特性的研究。结果:所分析的霍乱毒素B亚单位的103个氨基酸区域有共同的信息频谱特征,其主峰特征为F(0.3333,19),显示了霍乱菌株的霍乱毒素B亚单位的共同作用模式。霍乱毒素B亚单位蛋白的T68I氨基酸残基关键变异明显增加了F(0.3333)的特征峰高,可能对"人类"作用的模式有较大影响。经过系统聚类分析,发现了19个霍乱毒素B亚单位DNA序列多态。基于以上结果和流行病学资料,提出了19个霍乱弧菌的霍乱毒素B亚单位基因型。霍乱弧菌古典生物型参考株(569B)的霍乱毒素B亚单位基因型为1a(CTBgenotype 1a)。霍乱弧菌埃尔托生物型参考株(N16961)和霍乱弧菌O139血清群的参考株(4260B)的霍乱毒素B亚单位基因型都为2a(CTB genotype 2a)。结论:以上内容可对霍乱毒素B亚单位DNA和蛋白序列的多态性提供更好的理解;提供了对霍乱毒素B亚单位分子变异监测的一个技术和方案;可为今后预防和处置霍乱弧菌的感染和流行,进一步扩展了鉴别潜在的免疫、治疗和诊断的分子靶标的可能性。

关 键 词：霍乱弧菌 霍乱毒素 基因型 信息频谱法  

分 类 号：R378.3]