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利用ITS1和ITS4通用引物扩增香蕉枯萎病菌核酸片段鉴定其生理小种
Utility of Universal Primers, ITS1 and ITS4, to Amplify Sequences for Race Identification of Fusarium oxysporum f.sp. cubense
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]华南农业大学资源环境学院,广东广州510642 [2]珠海市农业科学研究中心,广东珠海519075 [3]华中农业大学生命科学技术学院,湖北武汉430070
基 金:广东省科技厅教育部产学研结合项目(2007B090400083);珠海市科技计划项目(PC20081078;PC20082043)资助
年 份:2010
卷 号:31
期 号:7
起止页码:1098-1102
语 种:中文
收录情况:CSCD、CSCD2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:利用真菌核糖体rDNA区通用引物ITS1和ITS4,扩增采集自香蕉的13株镰刀菌包括18S rDNA部分序列、ITS1-5.8S-ITS2全部序列和28S rDNA部分序列的片段,通过BLAST序列比对分析,确定13株菌为尖孢镰刀菌[Fusarium oxysporum]。采用最大简约法,以层出镰刀菌[F.proliferatum(EU151490)]和茄病镰刀菌[F.solani(GQ376116)]为外群,将13株菌的序列与BLAST检索获得的尖镰孢古巴专化型(F.oxysporum f.sp.Cubense)相应序列构建了系统发育树。系统发育分析结果显示,13株菌与NCBI登录的4个尖镰孢古巴专化型菌株一起被分成3个亚群,亚群聚类结果与回接鉴定结果及文献报道的生理小种结果完全一致。
关 键 词:香蕉枯萎病菌 rDNA—ITS 系统发育分析
分 类 号:S436.8]
参考文献:
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