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金钗石斛相关序列扩增多态性反应体系的正交优化研究
Optimization of sequence-related amplified polymorphism system in Dendrobium nobile based on orthogonal design
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]杭州师范大学生物化学与分子生物学杭州市重点实验室,浙江杭州310036
基 金:国家自然科学基金资助项目(30670199;30770185;30870180);浙江省自然科学基金资助项目(X305692;X301406);浙江省科技计划资助项目(2008C12081);杭州市重点实验室项目(20080432T06);钱江人才计划资助项目
年 份:2010
卷 号:41
期 号:8
起止页码:1353-1358
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、IPA、JST、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的建立金钗石斛Dendrobiumnobile相关序列扩增多态性(SRAP)反应体系,为金钗石斛分子生物学研究提供技术支持。方法运用L25(56)正交设计对影响金钗石斛SRAP反应的5个因素:模板DNA、Mg2+、dNTPs、Taq酶、引物在5个水平上进行优化试验,对PCR结果进行极差分析。结果金钗石斛SRAP反应最佳体系为:25μL PCR体系中含有20 ng模板DNA,2.0 mmol/L Mg2+,0.2 mmol/L dNTPs,1 UTaq酶,0.6μmol/L引物。各因素对SRAP反应的影响依次为:Taq酶>Mg2+>dNTPs>模板DNA>引物。结论所建立的金钗石斛SRAP反应体系具有标记位点清晰、多态性丰富、稳定性好等特点,可用于金钗石斛分子生物学的研究。
关 键 词:金钗石斛 SRAP 优化 正交设计
分 类 号:R286.1[中药学类]
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